Die Rechenmethode von Microsoft macht die genomische Sequenzierung siebenmal schneller

Microsoft Research arbeitet seit mehr als einem Jahrzehnt auf dem Gebiet der Genomik. Seine Innovation wird mit Projekten wie FaST-LMM für GWAS, homomorphe Verschlüsselung und dem Literome-Projekt fortgesetzt. Heute gab Microsoft bekannt, dass sie einen Weg gefunden haben, den Zeitaufwand für die wichtigsten rechnerischen Aspekte der Sequenzierung eines Genoms erheblich zu reduzieren.

Die Methode von Microsoft, den Burrows-Wheeler Aligner (BWA) und das Genome Analysis Toolkit (GATK) des Broad Institute auf Azure auszuführen, ist siebenmal schneller als die vorherige Version, sodass Forscher und Mediziner Ergebnisse in nur vier Stunden statt in 28 Stunden erhalten. BWA und GATK sind zwei der am häufigsten verwendeten Computerwerkzeuge, die in Kombination für die Genomsequenzierung verwendet werden. Dies ist eine signifikante Verbesserung, da Ärzte seltene und gefährliche genetische Erkrankungen 24 Stunden früher diagnostizieren und dem Patienten schneller eine lebensrettende Behandlung zukommen lassen könnten.

Microsoft besitzt eine nicht-exklusive Lizenz vom Broad Institute, um GATK auf Azure bereitzustellen. Microsoft plant nun, mit dem Broad Institute zusammenzuarbeiten, um diese Leistungsverbesserungen in zukünftige Versionen von GATK zu integrieren. Das Broad Institute würde diese Verbesserungen dann den Forschern zur Verfügung stellen.

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