Microsoft bilgi işlem yöntemi, genomik dizilemeyi yedi kat daha hızlı hale getiriyor
1 dk. okuman
Yayınlandı
Bu makaleyi paylaş
Bu kılavuzu geliştirin
MSPoweruser'ın editör ekibini ayakta tutmasına nasıl yardımcı olabileceğinizi öğrenmek için açıklama sayfamızı okuyun. Daha fazla
Microsoft Research, on yıldan fazla bir süredir genomik alanında çalışmaktadır. Yeniliği, GWAS için FaST-LMM, homomorfik şifreleme ve Literome projesi gibi projelerle devam ediyor. Bugün Microsoft, bir genom dizilemenin temel hesaplama yönlerini yapmak için gereken süreyi önemli ölçüde azaltmanın bir yolunu bulduklarını duyurdu.
Microsoft'un Azure üzerinde Burrows-Wheeler Aligner (BWA) ve Broad Institute's Genome Analysis Toolkit'i (GATK) çalıştırma yöntemi, önceki sürümden yedi kat daha hızlıdır ve araştırmacıların ve tıp uzmanlarının 28 yerine yalnızca dört saat içinde sonuç almasına olanak tanır. BWA ve GATK, genom dizilimi için kombinasyon halinde kullanılan en yaygın hesaplama araçlarından ikisidir. Bu, doktorların 24 saat önce nadir ve tehlikeli genetik durumları teşhis etmesine ve hastanın hayat kurtaran tedavisini daha hızlı almasına olanak tanıdığı için önemli bir gelişmedir.
Microsoft, Azure üzerinde GATK sağlamak için Broad Institute'tan münhasır olmayan bir lisansa sahiptir. Microsoft şimdi bu performans iyileştirmelerini GATK'nın gelecekteki sürümlerine dahil etmek için Broad Institute ile birlikte çalışmayı planlıyor. Broad Institute daha sonra bu iyileştirmeleri araştırmacıların kullanımına sunacaktı.
Daha fazlasını okuyun okuyun.
