Microsoft Excel a dat vina pentru erorile denumirii genelor în literatura științifică

Microsoft Excel este cel mai popular software pentru foi de calcul din lume, iar utilizarea sa se întinde pe toate industriile. Un nou studiu de cercetare publicat pe Biologie genomatică susține că problemele de corectare automată Excel au afectat aproximativ o cincime din lucrările din jurnalele de genomică. Când este utilizat cu setări implicite, Excel convertește numele genelor în date și numere în virgulă mobilă.

De exemplu, simboluri ale genelor, cum ar fi sept 2 (septin 2) și MARCH1 [Degetul inelar asociat cu membrană (C3HC4) 1, E3 Ubiquitin Protein Ligase] sunt convertite implicit în „2-Sep” și, respectiv, „1-Mar”. În plus, identificatorii RIKEN au fost descriși ca fiind convertiți automat în numere în virgulă mobilă (adică de la accesarea „2310009E13” la „2.31E+13”).

De fapt, aceasta nu este o problemă nou descoperită. Problema conversiei involuntare de Excel a simbolurilor genelor în date și numere în virgulă mobilă a fost descrisă inițial în 2004. Deoarece majoritatea utilizatorilor obișnuiți se așteaptă ca Excel să corecteze automat SEP2 la 2-Sep, Microsoft a decis să nu-și schimbe comportamentul. Dar conversia simbolului genei este problematică, deoarece aceste fișiere sunt o resursă importantă în comunitatea genomică, care sunt frecvent refolosite. Acest studiu a analizat 35,175 de fișiere Excel suplimentare, găsind 7467 liste de gene atașate la 3597 de lucrări publicate. Ei au confirmat erori ale numelor genelor în 987 de fișiere suplimentare din 704 articole publicate.

Se pare că nu există o modalitate directă de a dezactiva permanent formatarea automată a datelor în Excel și această problemă apare și în alte programe de calcul populare, cum ar fi LibreOffice Calc sau Apache OpenOffice Calc. Acest studiu de cercetare a fost realizat pentru a crește gradul de conștientizare a acestei probleme în rândul comunității academice de genomică.

Citiți raportul complet aici.