Metoda obliczeniowa firmy Microsoft przyspiesza sekwencjonowanie genomu siedmiokrotnie
1 minuta. czytać
Opublikowany
Udostępnij ten artykuł
Ulepsz ten przewodnik
Przeczytaj naszą stronę z informacjami, aby dowiedzieć się, jak możesz pomóc MSPoweruser w utrzymaniu zespołu redakcyjnego Czytaj więcej
Microsoft Research od ponad dekady zajmuje się genomiką. Jego innowacyjność jest kontynuowana w projektach takich jak FaST-LMM dla GWAS, szyfrowanie homomorficzne i projekt Literome. Dzisiaj Microsoft ogłosił, że wymyślił sposób na znaczne skrócenie czasu potrzebnego do wykonania głównych obliczeniowych aspektów sekwencjonowania genomu.
Metoda Microsoftu uruchamiania Burrows-Wheeler Aligner (BWA) i zestawu narzędzi analizy genomu Broad Institute (GATK) na platformie Azure jest siedmiokrotnie szybsza niż w poprzedniej wersji, dzięki czemu naukowcy i lekarze mogą uzyskać wyniki w ciągu zaledwie czterech godzin zamiast 28. BWA i GATK to dwa z najpopularniejszych narzędzi obliczeniowych używanych w połączeniu do sekwencjonowania genomu. Jest to znacząca poprawa, ponieważ może pozwolić lekarzom na diagnozowanie rzadkich i niebezpiecznych schorzeń genetycznych 24 godziny wcześniej, a tym samym szybsze rozpoczęcie leczenia ratującego życie pacjenta.
Firma Microsoft posiada niewyłączną licencję Broad Institute na udostępnianie GATK na platformie Azure. Microsoft planuje teraz współpracować z Broad Institute w celu włączenia tych ulepszeń wydajności do przyszłych wersji GATK. Broad Institute udostępniłby następnie te ulepszenia naukowcom.
Przeczytaj więcej na ten temat tutaj.
