Microsoft Excel beschuldigd van gennaamfouten in de wetenschappelijke literatuur

Microsoft Excel is 's werelds meest populaire spreadsheetsoftware en het gebruik ervan strekt zich uit over verschillende sectoren. Een nieuwe onderzoeksstudie gepubliceerd op Genoombiologie beweert dat problemen met automatische correctie van Excel ongeveer een vijfde van de genomics-tijdschriften hebben getroffen. Bij gebruik met standaardinstellingen converteert Excel gennamen naar datums en getallen met drijvende komma.

Bijvoorbeeld, gensymbolen zoals SEPT 2 (2 september) en MARCH1 [Membraan-geassocieerde ringvinger (C3HC4) 1, E3 Ubiquitin Protein Ligase] worden standaard omgezet in respectievelijk '2-Sep' en '1-Mar'. Verder werd beschreven dat RIKEN-ID's automatisch worden omgezet in getallen met drijvende komma (dwz van inschrijving '2310009E13' naar '2.31E+13').

Eigenlijk is dit geen nieuw ontdekt probleem. Het probleem dat Excel per ongeluk gensymbolen omzet in datums en getallen met drijvende komma werd oorspronkelijk beschreven in 2004. Aangezien de meeste gebruikers verwachten dat Excel automatisch SEP2 naar 2-sep corrigeert, heeft Microsoft besloten het gedrag niet te veranderen. Maar de conversie van gensymbolen is problematisch omdat deze bestanden een belangrijke hulpbron zijn in de genomics-gemeenschap die vaak opnieuw wordt gebruikt. Deze studie screende 35,175 aanvullende Excel-bestanden en vond 7467 genenlijsten bij 3597 gepubliceerde artikelen. Ze bevestigden gennaamfouten in 987 aanvullende bestanden van 704 gepubliceerde artikelen.

Het lijkt erop dat er geen directe manier is om de automatische opmaak van datums in Excel permanent te deactiveren en dit probleem doet zich ook voor in andere populaire spreadsheetprogramma's zoals LibreOffice Calc of Apache OpenOffice Calc. Dit onderzoek werd uitgevoerd om de genomica-academische gemeenschap bewust te maken van dit probleem.

Lees het volledige rapport hier.