De computermethode van Microsoft maakt genomische sequencing zeven keer sneller

Microsoft Research werkt al meer dan tien jaar op het gebied van genomics. De innovatie gaat verder met projecten zoals FaST-LMM voor GWAS, homomorfe codering en het Literome-project. Microsoft heeft vandaag aangekondigd dat ze een manier hebben gevonden om de tijd die nodig is om de belangrijkste computationele aspecten van het sequencen van een genoom uit te voeren, aanzienlijk te verminderen.

De methode van Microsoft om de Burrows-Wheeler Aligner (BWA) en de Genome Analysis Toolkit (GATK) van het Broad Institute op de Azure uit te voeren, is zeven keer sneller dan de vorige versie, waardoor onderzoekers en medische professionals resultaten kunnen krijgen in slechts vier uur in plaats van 28. BWA en GATK zijn twee van de meest voorkomende computerhulpmiddelen die in combinatie worden gebruikt voor genoomsequencing. Dit is een aanzienlijke verbetering, aangezien artsen hierdoor 24 uur eerder zeldzame en gevaarlijke genetische aandoeningen kunnen diagnosticeren, waardoor de levensreddende behandeling van de patiënt sneller kan worden uitgevoerd.

Microsoft heeft een niet-exclusieve licentie van het Broad Institute om GATK op Azure te leveren. Microsoft heeft nu plannen om samen te werken met het Broad Institute om deze prestatieverbeteringen op te nemen in toekomstige versies van GATK. Broad Institute zou deze verbeteringen vervolgens beschikbaar stellen aan onderzoekers.

Lees er meer over hier.