Microsoft Exceliä syytettiin geenien nimivirheistä tieteellisessä kirjallisuudessa

Microsoft Excel on maailman suosituin taulukkolaskentaohjelmisto ja sen käyttö kattaa eri toimialat. Uusi tutkimus julkaistiin Genomibiologia väittää, että Excelin automaattisen korjauksen ongelmat ovat vaikuttaneet noin viidesosaan genomiikan aikakauslehtipapereista. Oletusasetusten kanssa käytettynä Excel muuntaa geenien nimet päivämääriksi ja liukulukuiksi.

Esimerkiksi geenisymbolit, kuten 2. syyskuuta (2. syys) ja MARCH1 [Membrane-Associated Ring Finger (C3HC4) 1, E3 Ubiquitin Protein Ligase] muunnetaan oletuksena "2-Sep" ja "1-Mar", vastaavasti. Lisäksi RIKEN-tunnisteiden kuvattiin muunnettavan automaattisesti liukulukuiksi (eli liittymisestä '2310009E13' numeroon '2.31E+13').

Itse asiassa tämä ei ole uusi havaittu ongelma. Ongelma Excelin vahingossa muuntamisesta geenisymboleiksi päivämääriksi ja liukulukuiksi kuvattiin alun perin vuonna 2004. Koska useimmat käyttäjät odottavat Excelin korjaavan automaattisesti SEP2:n 2. syyskuuta, Microsoft on päättänyt olla muuttamatta toimintaansa. Mutta geenisymbolien muuntaminen on ongelmallista, koska nämä tiedostot ovat tärkeä resurssi genomiikkayhteisössä, ja niitä käytetään usein uudelleen. Tässä tutkimuksessa seulottiin 35,175 7467 Excel-lisätiedostoa ja löydettiin 3597 geeniluetteloa, jotka oli liitetty 987 julkaistuun julkaisuun. He vahvistivat geenin nimivirheet 704 lisätiedostossa XNUMX julkaistusta artikkelista.

Näyttää siltä, ​​ettei ole suoraa tapaa poistaa pysyvästi automaattista päivämäärien muotoilua käytöstä Excelissä, ja tämä ongelma ilmenee myös muissa suosituissa taulukkolaskentaohjelmissa, kuten LibreOffice Calc tai Apache OpenOffice Calc. Tämä tutkimus tehtiin lisäämään tietoisuutta tästä ongelmasta genomiikan akateemisen yhteisön keskuudessa.

Lue koko raportti tätä.