Microsoftin laskentamenetelmä nopeuttaa genomista sekvensointia seitsemän kertaa
1 min. lukea
Julkaistu
Jaa tämä artikkeli
Paranna tätä ohjetta
Lue ilmoitussivumme saadaksesi selville, kuinka voit auttaa MSPoweruseria ylläpitämään toimitustiimiä Lue lisää
Microsoft Research on työskennellyt genomiikan parissa yli vuosikymmenen ajan. Sen innovaatio jatkuu projekteissa, kuten FaST-LMM GWAS:lle, homomorfinen salaus ja Literome-projekti. Microsoft ilmoitti tänään, että he ovat keksineet tavan lyhentää merkittävästi aikaa, joka kuluu genomin sekvensoinnin tärkeimpien laskennallisten näkökohtien suorittamiseen.
Microsoftin menetelmä käyttää Burrows-Wheeler Aligneria (BWA) ja Broad Instituten genomianalyysityökalua (GATK) Azuressa on seitsemän kertaa nopeampi kuin edellinen versio, joten tutkijat ja lääketieteen ammattilaiset voivat saada tuloksia vain neljässä tunnissa 28 tunnin sijaan. BWA ja GATK ovat kaksi yleisimmistä laskentatyökaluista, joita käytetään yhdessä genomin sekvensointiin. Tämä on merkittävä parannus, koska sen avulla lääkärit voivat diagnosoida harvinaiset ja vaaralliset geneettiset sairaudet 24 tuntia aikaisemmin, jolloin potilaan hengenpelastava hoito saadaan nopeammin.
Microsoftilla on ei-yksinoikeudellinen Broad Instituten lisenssi tarjota GATK-palvelua Azuressa. Microsoft aikoo nyt tehdä yhteistyötä Broad Instituten kanssa sisällyttääkseen nämä suorituskykyparannukset tuleviin GATK-versioihin. Broad Institute antaisi nämä parannukset tutkijoiden saataville.
Lue lisää tätä.
Käyttäjäfoorumi
0-viestit