Η υπολογιστική μέθοδος της Microsoft καθιστά τη γονιδιωματική αλληλουχία επτά φορές ταχύτερη

Η Microsoft Research εργάζεται στον τομέα της γονιδιωματικής για περισσότερο από μια δεκαετία. Η καινοτομία του συνεχίζεται με έργα όπως το FaST-LMM για GWAS, την ομομορφική κρυπτογράφηση και το έργο Literome. Σήμερα, η Microsoft ανακοίνωσε ότι έχει βρει έναν τρόπο να μειώσει σημαντικά τον χρόνο που χρειάζεται για να γίνουν οι κύριες υπολογιστικές πτυχές της αλληλουχίας ενός γονιδιώματος.

Η μέθοδος της Microsoft για την εκτέλεση του Burrows-Wheeler Aligner (BWA) και του Broad Institute's Genome Analysis Toolkit (GATK) στο Azure είναι επτά φορές ταχύτερη από την προηγούμενη έκδοση, επιτρέποντας στους ερευνητές και τους επαγγελματίες του ιατρικού κλάδου να έχουν αποτελέσματα σε μόλις τέσσερις ώρες αντί για 28. Το BWA και το GATK είναι δύο από τα πιο κοινά υπολογιστικά εργαλεία που χρησιμοποιούνται σε συνδυασμό για τον προσδιορισμό της αλληλουχίας του γονιδιώματος. Αυτή είναι μια σημαντική βελτίωση, καθώς θα μπορούσε να επιτρέψει στους γιατρούς να διαγνώσουν σπάνιες και επικίνδυνες γενετικές παθήσεις 24 ώρες νωρίτερα, επιταχύνοντας τη σωτήρια θεραπεία του ασθενούς.

Η Microsoft κατέχει μια μη αποκλειστική άδεια χρήσης από το Broad Institute για την παροχή GATK στο Azure. Η Microsoft έχει τώρα σχέδια να συνεργαστεί με το Broad Institute για να ενσωματώσει αυτές τις βελτιώσεις απόδοσης σε μελλοντικές εκδόσεις του GATK. Το Broad Institute θα έθετε στη συνέχεια αυτές τις βελτιώσεις διαθέσιμες στους ερευνητές.

Διαβάστε περισσότερα για αυτό εδώ.