Výpočetní metoda společnosti Microsoft činí sekvenování genomu sedmkrát rychlejší
1 min. číst
Publikované dne
Sdílejte tento článek
Vylepšete tuto příručku
Přečtěte si naši informační stránku a zjistěte, jak můžete pomoci MSPoweruser udržet redakční tým Dozvědět se více
Microsoft Research působí v oblasti genomiky již více než deset let. Jeho inovace pokračuje s projekty jako FaST-LMM pro GWAS, homomorfní šifrování a projekt Literome. Dnes Microsoft oznámil, že přišel na způsob, jak výrazně zkrátit čas potřebný k provedení hlavních výpočetních aspektů sekvenování genomu.
Metoda Microsoftu, která spouští Burrows-Wheeler Aligner (BWA) a Broad Institute's Genome Analysis Toolkit (GATK) v Azure je sedmkrát rychlejší než předchozí verze, což umožňuje výzkumníkům a lékařům získat výsledky za pouhé čtyři hodiny namísto 28. BWA a GATK jsou dva nejběžnější výpočetní nástroje používané v kombinaci pro sekvenování genomu. Jedná se o významné zlepšení, protože by to lékařům mohlo umožnit diagnostikovat vzácné a nebezpečné genetické stavy o 24 hodin dříve, a tím rychleji získat život zachraňující léčbu pacienta.
Microsoft je držitelem nevýhradní licence od Broad Institute k poskytování GATK v Azure. Microsoft nyní plánuje spolupracovat s Broad Institute na začlenění těchto vylepšení výkonu do budoucích verzí GATK. Broad Institute by pak tato vylepšení zpřístupnil výzkumníkům.
Přečtěte si více o tom zde.
