Обчислювальний метод Microsoft робить геномне секвенування в сім разів швидше
1 хв. читати
Опубліковано
Поділитися цією статтею
Удосконалити цей посібник
Прочитайте нашу сторінку розкриття інформації, щоб дізнатися, як ви можете допомогти MSPoweruser підтримувати редакційну команду Читати далі
Microsoft Research працює в галузі геноміки більше десяти років. Його інновації продовжуються в таких проектах, як FaST-LMM для GWAS, гомоморфне шифрування та проект Literome. Сьогодні Microsoft оголосила, що вони винайшли спосіб значно скоротити час, необхідний для виконання основних обчислювальних аспектів секвенування геному.
Метод Microsoft для запуску інструменту Burrows-Wheeler Aligner (BWA) і Broad Institute's Genome Analysis Toolkit (GATK) на Azure у сім разів швидший за попередню версію, що дозволяє дослідникам і медичним працівникам отримувати результати лише за чотири години замість 28. BWA та GATK є двома найпоширенішими обчислювальними інструментами, які використовуються разом для секвенування геному. Це значне покращення, оскільки воно може дозволити лікарям діагностувати рідкісні та небезпечні генетичні захворювання на 24 години раніше, швидше надавши пацієнту рятівне лікування.
Microsoft має невиключну ліцензію від Broad Institute на надання GATK на Azure. Зараз Microsoft планує співпрацювати з Broad Institute, щоб включити ці покращення продуктивності в майбутні версії GATK. Тоді Broad Institute надасть ці вдосконалення дослідникам.
Детальніше про це тут.
