A Microsoft számítástechnikai módszere hétszer gyorsabbá teszi a genomi szekvenálást

A Microsoft Research több mint egy évtizede dolgozik a genomika területén. Innovációja olyan projektekkel folytatódik, mint a FaST-LMM a GWAS-hoz, a homomorf titkosítás és a Literome projekt. A Microsoft ma bejelentette, hogy olyan módszert dolgoztak ki, amellyel jelentősen csökkenthetik a genom szekvenálásának főbb számítási szempontjainak elvégzéséhez szükséges időt.

A Microsoft módszere a Burrows-Wheeler Aligner (BWA) és a Broad Institute Genome Analysis Toolkit (GATK) Azure-on való futtatására hétszer gyorsabb, mint az előző verzió, így a kutatók és az egészségügyi szakemberek 28 helyett mindössze négy óra alatt érhetik el az eredményeket. A BWA és a GATK a két legelterjedtebb számítási eszköz, amelyet a genomszekvenáláshoz kombinálva használnak. Ez jelentős előrelépés, mivel lehetővé teheti az orvosok számára, hogy 24 órával korábban diagnosztizálják a ritka és veszélyes genetikai állapotokat, és gyorsabban kapják meg a beteg életmentő kezelését.

A Microsoft a Broad Institute nem kizárólagos licencével rendelkezik a GATK Azure-on való biztosítására. A Microsoft most azt tervezi, hogy együttműködik a Broad Institute-tal, hogy beépítse ezeket a teljesítményjavításokat a GATK jövőbeli verzióiba. A Broad Institute ezután elérhetővé tenné ezeket a fejlesztéseket a kutatók számára.

További részletek itt.