Microsoft Excel wird in der wissenschaftlichen Literatur für Gennamensfehler verantwortlich gemacht
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Microsoft Excel ist die weltweit beliebteste Tabellenkalkulationssoftware und wird branchenübergreifend eingesetzt. Eine neue Forschungsstudie veröffentlicht am Genombiologie behauptet, dass Probleme mit der automatischen Excel-Korrektur etwa ein Fünftel der Artikel in Genomik-Zeitschriften betroffen haben. Bei Verwendung mit Standardeinstellungen konvertiert Excel Gennamen in Datumsangaben und Gleitkommazahlen.
Zum Beispiel Gensymbole wie 2. SEPT (2. September) und MARCH1 [Membrane-Associated Ring Finger (C3HC4) 1, E3 Ubiquitin Protein Ligase] werden standardmäßig in „2-Sep“ bzw. „1-Mar“ umgewandelt. Darüber hinaus wurde beschrieben, dass RIKEN-Identifikatoren automatisch in Fließkommazahlen konvertiert werden (dh von Accession '2310009E13' zu '2.31E+13').
Eigentlich ist dies kein neu entdecktes Problem. Das Problem, dass Excel versehentlich Gensymbole in Datumsangaben und Fließkommazahlen umwandelt, wurde ursprünglich im Jahr 2004 beschrieben. Da die meisten gewöhnlichen Benutzer erwarten, dass Excel SEP2 automatisch auf 2-Sep korrigiert, hat Microsoft beschlossen, sein Verhalten nicht zu ändern. Die Gensymbolkonvertierung ist jedoch problematisch, da diese Dateien eine wichtige Ressource in der Genomik-Community sind, die häufig wiederverwendet wird. Diese Studie durchsuchte 35,175 ergänzende Excel-Dateien und fand 7467 Genlisten, die 3597 veröffentlichten Artikeln beigefügt waren. Sie bestätigten Gennamensfehler in 987 ergänzenden Dateien von 704 veröffentlichten Artikeln.
Es scheint, dass es keine direkte Möglichkeit gibt, die automatische Formatierung von Datumsangaben in Excel dauerhaft zu deaktivieren, und dieses Problem tritt auch in anderen gängigen Tabellenkalkulationsprogrammen wie LibreOffice Calc oder Apache OpenOffice Calc auf. Diese Forschungsstudie wurde durchgeführt, um das Bewusstsein für dieses Problem in der akademischen Gemeinschaft der Genomik zu schärfen.
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